DASP使用说明

目录：

• 1. 软件简介
  • 1.1. 功能介绍
  • 1.2. 计算流程
  • 1.3. 运行环境需求
    • 1.3.1. 第一性原理计算软件：VASP
    • 1.3.2. Materials Project与本地数据库
  • 1.4. 使用范围
• 2. 模块介绍
  • 2.1. PREPARE模块
  • 2.2. TSC模块
  • 2.3. DEC模块
  • 2.4. DDC模块
  • 2.5. CDC模块
• 3. 输入参数说明
  • 3.1. dasp.in模板
  • 3.2. 任务系统管理相关参数
    • 3.2.1. cluster
    • 3.2.2. node_number
    • 3.2.3. core_per_node
    • 3.2.4. queue
    • 3.2.5. max_time
    • 3.2.6. vasp_path_dec, vasp_path_tsc, vasp_path_cdc
    • 3.2.7. job_name
    • 3.2.8. potcar_path
    • 3.2.9. max_job
  • 3.3. TSC相关参数
    • 3.3.1. database_api
    • 3.3.2. key_phases_recalc
    • 3.3.3. excluded_phase
    • 3.3.4. axis_element_x
    • 3.3.5. axis_element_y
    • 3.3.6. mid_element
    • 3.3.7. fixed_chem_potential
    • 3.3.8. plot_2d
    • 3.3.9. plot_3d
    • 3.3.10. tsc_only
  • 3.4. DEC相关参数
    • 3.4.1. level
    • 3.4.2. min_atom
    • 3.4.3. max_atom
    • 3.4.4. intrinsic
    • 3.4.5. vacancy
    • 3.4.6. antisite
    • 3.4.7. interstitial
    • 3.4.8. doping
    • 3.4.9. impurity
    • 3.4.10. substitution_doping
    • 3.4.11. interstitial_doping
    • 3.4.12. num_inter
    • 3.4.13. inter_host_distance
    • 3.4.14. inter_inter_distance
    • 3.4.15. correction
    • 3.4.16. epsilon
    • 3.4.17. Eg_real
    • 3.4.18. distorted_defect
    • 3.4.19. distorted_number
    • 3.4.20. complex
  • 3.5. DDC相关参数
    • 3.5.1. ddc_temperature
    • 3.5.2. ddc_mass
    • 3.5.3. ddc_path
  • 3.6. CDC相关参数
    • 3.6.1. cdc_defect
    • 3.6.2. cdc_job
    • 3.6.3. cdc_temperature
    • 3.6.4. cdc_charge
    • 3.6.5. cdc_band
    • 3.6.6. spin_channel
    • 3.6.7. refractive_index
    • 3.6.8. dQ_range
    • 3.6.9. fitting_method
    • 3.6.10. guassian_smearing
    • 3.6.11. el_ph
• 4. 输出文件介绍
  • 4.1. PREPARE模块的输出文件
    • 4.1.1. INCAR
    • 4.1.2. POSCAR
    • 4.1.3. KPOINTS
    • 4.1.4. POTCAR
    • 4.1.5. 任务脚本文件
    • 4.1.6. 马德隆常数计算目录
    • 4.1.7. HSE交换参数计算目录
    • 4.1.8. 超胞原子位置优化计算目录
    • 4.1.9. 1prepare.out
  • 4.2. TSC模块的输出文件
    • 4.2.1. materials_info.yaml
    • 4.2.2. materials_info_recalc.yaml
    • 4.2.3. pure_phase_energy.yaml
    • 4.2.4. key_phases_info_recalc.yaml
    • 4.2.5. stable_2d.out
    • 4.2.6. stable_recalc_2d.out
    • 4.2.7. stable.out
    • 4.2.8. stable_recalc.out
    • 4.2.9. ori_data_MP
    • 4.2.10. 2tsc.out
  • 4.3. DEC模块的输出文件
    • 4.3.1. Formation_Energy_(Intrinsic_Defect)
    • 4.3.2. Transition_Level_(Intrinsic_Defect)
    • 4.3.3. 3dec.out
  • 4.4. DDC模块的输出文件
    • 4.4.1. DefectParams.txt
    • 4.4.2. Fermi.dat
    • 4.4.3. Carrier.dat
    • 4.4.4. Defect_charge.dat
    • 4.4.5. 4ddc.out
  • 4.5. CDC模块的输出文件
    • 4.5.1. 5cdc.out
    • 4.5.2. lineshape.dat & lineshape.png
    • 4.5.3. ccdiagram.png
    • 4.5.4. pl.out
    • 4.5.5. rad_rate.out
    • 4.5.6. el_ph_calc.list
    • 4.5.7. nonrad_calc.list
    • 4.5.8. overlap.dat
    • 4.5.9. eigenvalue_i.dat
    • 4.5.10. eigenvalue_f.dat
    • 4.5.11. wavefunction_i.dat
    • 4.5.12. wavefunction_f.dat
    • 4.5.13. nonrad_rate.out
    • 4.5.14. nonradiative_rate.dat & coefficient.png
• 5. 应用案例
  • 5.1. CdTe的本征缺陷计算
    • 5.1.1. 准备计算PREPARE
      • 5.1.1.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.1.1.2. 使用DASP产生必要输入文件
      • 5.1.1.3. PREPARE模块运行流程
    • 5.1.2. 热力学稳定性和元素化学势计算TSC
      • 5.1.2.1. 运行TSC模块
      • 5.1.2.2. TSC模块运行流程
    • 5.1.3. 缺陷形成能和转变能级计算DEC
      • 5.1.3.1. 运行DEC模块
      • 5.1.3.2. DEC模块运行流程
    • 5.1.4. 缺陷浓度和费米能级计算DDC
      • 5.1.4.1. 运行DDC模块
      • 5.1.4.2. DDC模块运行流程
  • 5.2. HfO2的本征缺陷计算
    • 5.2.1. 准备计算PREPARE
      • 5.2.1.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.2.1.2. 使用DASP产生必要输入文件
      • 5.2.1.3. PREPARE模块运行流程
    • 5.2.2. 热力学稳定性和元素化学势计算TSC
      • 5.2.2.1. 运行TSC模块
      • 5.2.2.2. TSC模块运行流程
    • 5.2.3. 缺陷形成能和转变能级计算DEC
      • 5.2.3.1. 运行DEC模块
      • 5.2.3.2. DEC模块运行流程
    • 5.2.4. 缺陷浓度和费米能级计算DDC
      • 5.2.4.1. 运行DDC模块
      • 5.2.4.2. DDC模块运行流程
  • 5.3. H掺杂Ga2O3的缺陷计算
    • 5.3.1. 准备计算PREPARE
      • 5.3.1.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.3.1.2. 使用DASP产生必要输入文件
      • 5.3.1.2. PREPARE模块运行流程
    • 5.3.2. 热力学稳定性和元素化学势计算TSC
      • 5.3.2.1. 运行TSC模块
      • 5.3.2.2. TSC模块运行流程
    • 5.3.3. 缺陷形成能和转变能级计算DEC
      • 5.3.3.1. 运行DEC模块
      • 5.3.3.2. DEC模块运行流程
    • 5.3.4. 缺陷浓度和费米能级计算DDC
      • 5.3.4.1. 运行DDC模块
      • 5.3.4.2. DDC模块运行流程
  • 5.4. ZnGeP2的本征缺陷计算
    • 5.4.1. 准备计算PREPARE
      • 5.4.1.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.4.1.2. 使用DASP产生必要输入文件
      • 5.4.1.3. PREPARE模块运行流程
    • 5.4.2. 热力学稳定性和元素化学势计算TSC
      • 5.4.2.1. 运行TSC模块
      • 5.4.2.2. TSC模块运行流程
    • 5.4.3. 缺陷形成能和转变能级计算DEC
      • 5.4.3.1. 运行DEC模块
      • 5.4.3.2. DEC模块运行流程
    • 5.4.4. 缺陷浓度和费米能级计算DDC
      • 5.4.4.1. 运行DDC模块
      • 5.4.4.2. DDC模块运行流程
    • 5.4.5. 辐射跃迁系数和光致发光谱计算CDC
      • 5.4.5.1. 运行CDC模块
      • 5.4.5.2. 前期计算
      • 5.4.5.3. 辐射俘获系数计算流程
      • 5.4.5.4. CDC模块PL谱计算流程
    • 5.4.6. 非辐射俘获系数计算CDC
      • 5.4.6.1. 运行CDC模块
      • 5.4.6.2. 前期计算
      • 5.4.6.3. CDC模块非辐射俘获系数计算流程
  • 5.5. 双钙钛矿材料稳定性的快速计算预测
    • 5.5.1. Cs2AgBiCl6 （预测结果：稳定）
      • 5.5.1.1. 准备文件
      • 5.5.1.2. 计算与分析
    • 5.5.2. K2LiYF6 （预测结果：不稳定）
      • 5.5.2.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.5.2.2. 计算与分析
      • 5.5.2.3. 追加计算与分析
    • 5.5.3. Rb2LiInI6 （预测结果：不稳定）
      • 5.5.3.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.5.2.2. 计算与分析
  • 5.6. GaN中 \(C_N\) 缺陷的非辐射俘获系数计算
    • 5.6.1. 运行CDC模块
    • 5.6.2. 非辐射俘获系数计算流程
  • 5.7. ZnGeP2的复合缺陷计算
    • 5.7.1. ZnGeP2复合缺陷计算设置
    • 5.7.2. ZnGeP2中性复合缺陷结构优化及总能计算流程
    • 5.7.3. ZnGeP2带电复合缺陷结构优化及总能计算流程
    • 5.7.4. ZnGeP2复合缺陷形成能计算及绘图
  • 5.8. GaN中本征点缺陷和复合缺陷计算
    • 5.8.1. 准备计算PREPARE
      • 5.8.1.1. 准备POSCAR与dasp.in
      • 5.8.1.2. 使用DASP产生必要输入文件
      • 5.8.1.3. PREPARE模块运行流程
    • 5.8.2. 热力学稳定性和元素化学势计算TSC
      • 5.8.2.1. 运行TSC模块
      • 5.8.2.2. TSC模块运行流程
    • 5.8.3. 缺陷形成能和转变能级计算DEC
      • 5.8.3.1. 运行DEC模块
      • 5.8.3.2. DEC模块运行流程
    • 5.8.4. GaN中复合缺陷计算
    • 5.8.4.1. 复合缺陷计算设置
    • 5.8.4.2. GaN中电中性复合缺陷结构优化及总能计算流程
    • 5.8.4.3. GaN带电复合缺陷结构优化及总能计算流程
    • 5.8.4.4. GaN复合缺陷形成能计算及绘图
• 6. 常见问题及解决方案
  • 6.1. DASP相关问题
    • 6.1.1. 如何配置 Pymatgen ？
    • 6.1.2. 如何放置 sxdefectalign 脚本？
    • 6.1.3. Prepare 和 Dec 模块vasp计算遇到报错应如何处理 ？
    • 6.1.4. 硬盘存储空间满了，程序无法正常执行。
    • 6.1.5. vasp_path_tsc 和 vasp_path_dec 可否设置一样？
    • 6.1.6. 能否考虑自旋极化和自旋轨道耦合？
  • 6.2 VASP计算相关问题
    • 6.2.1. SYMPREC 参数相关问题导致VASP报错。
    • 6.2.2. 使用 level=2或3 ，HSE自洽计算时电子步不收敛。
    • 6.2.3. TSC计算的第一阶段，relaxation1 relaxtion2或者static计算的电子步不收敛。
    • 6.2.3. DEC在优化缺陷超胞时，遇到没收敛但是计算停止的情况。
• 7. 发布说明
  • 2023B 版本：
  • 2022B 版本：