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分子动力学专题培训

鸿之微将于4月26日-4月28日在鸿之微上海举办分子动力学专题培训,本期培训面向行业研究学者和应用人员。由浅入深,从理论讲解、案例分析再到编码实战。

    提前天数
  • 提前10天报名
  • 正常时间报名
    人数
  • 3人缴费
  • 2人缴费
  • 1人缴费
    合计
  • ¥3000.00
培训介绍

      鸿之微科技(上海)股份有限公司致力于材料设计软件开发、集成电路工艺参数提取软件及集成电路器件设计软件的开发和应用。鸿之微拥有多个完全自主知识产权的材料及器件设计软件,包括大型材料和器件设计平台DeviceStudio、基于线性组合原子轨道基组及非平衡格林函数-密度泛函理论的材料和量子输运计算软件Nanodcal、有机发光材料设计软件MOMAP、大体系DFT计算软件RESCU、相场理论计算模拟软件STEMS、基于紧束缚近似的输运计算软件Nanoskim,及紧束缚参数优化软件Nanoskif等。基于这些核心科学软件,鸿之微开发了多款专用的新兴电子器件设计软件,OLED材料设计平台,建设了电子器件设计云平台,为广大材料及电子器件从业人员提供强大的科技计算支持。

      

      分子动力学模拟(Molecular Dynamics)是近年来飞速发展的一种分子模拟方法,已经被广泛应用于化学化工、材料科学与工程、物理、生物医药等科学和技术领域,起到越来越重要的作用。MD模拟用来研究不能用解析方法来解决的复合体系的平衡性质和力学性质 ,用来搭建理论和实验的一个桥梁 ,在数学 、生物、化学 、物理学、材料科学和计算机科学交叉学科占据重要地位。开源的分子动力学模拟软件LAMMPS具有有良好的并行扩展性,可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,并提供支持多种势函数,吸引越来越多的计算模拟科研人员使用,基础培训班可以为广大LAMMPS初学者提供一个良好学习平台,在较短的时间内对分子动力学理论以及LAMMPS使用的基础知识进行更有效的掌握,为今后更深一步的分子动力学模拟打下坚实的基础。    

 

培训时间: 2019年4月26日~2019年4月28日

培训地点:上海市浦东新区金海路1000号12号楼东区( 021-50550302)

联 系 人:柳傲蕾      联系方式:17717399103   Email:liuaolei@hzwtech.com

培训说明:为保证培训质量,本次培训限额15人,报满即止!


培训日程
第一天 (上)

· 分子动力学模拟基础入门

材料模拟方法发展史和各尺度模拟方法简介

分子动力学基本原理和基本框架

分子动力学关键技术和计算流程:建模 > 模拟 > 结果分析

分子模拟条件和环境的控制:系综的选择

分子模拟加速方法:周期性边界条件,并行计算,GPU加速

力场(经验势函数):如何针对不同系统选用不同的势函数

第一天 (下)

· Linux高性能计算入门 + Lammps软件安装实践

掌握Linux(CentOS)系统的安装(物理机或虚拟机)

掌握科学计算常用Linux命令

掌握在Linux服务器上安装并行计算软件openmpi,数学计算库fftw等

掌握在Linux服务器上安装Torque Pbs任务管理排队软件,科学管理计算任务

掌握Lammps软件安装基本方法介绍,并行版Lammps,GPU加速版Lammps编译安装

 

第二天 (上)

· LAMMPS 模拟详解

学习编写Lammps计算所需输入/输出文件(in文件,data文件,lammpstrj文件)

学习Lammps计算流程控制,自定义计算流程及施加各种外界条件

学习Lammps力场势函数设定,针对特定计算体系分析,准确选择力场

第二天 (下)

· LAMMPS 模拟入门实践

上机实践,使用Lammps操作完成crack、friction等问题的分子动力学模拟

分析模拟所得结果,完成体系原子受力;体系总能、动能、势能、温度;特定局部原子group能量、温度等数据计算

 

第三天 (上)

· LAMMPS 进阶建模

使用软件 MS,Packmol以及Lammps自有命令完成各种混合溶液模型,固液混合模型,界面模型等模拟模型建模

将所建模型或各种格式结构文件转化为Lammps要求data文件格式方法

在文献中寻找合适力场参数,并导入自己的Lammps in文件

第三天 (下)

· Lammps 后处理/进阶数据分析方法

通过多个实例的演示学习如何设计合理的模拟计算流程,并写成Lammps in文件

MS,VMD,VESTA等结构显示软件做出漂亮的结构图片和视频

体系动力学特性分析(均方差位移(MSD),结合Origin软件计算扩散系数等)

体系结构特征数据分析(结合VMD软件,进行原子密度分布分析(Density profile),计算径向分布函数(RDF))


培训报名

费用 3000元/人     (备注:包含资料费、会议费、午餐;交通和食宿等费用自理)

报名费用

两人以上且提前十天缴费

3000元/人

2800元/人

 

付款方式:

1.银行转账

开户行:     建设银行上海金桥支行

 名:       鸿之微科技(上海)股份有限公司

 号:       3100 1576 6130 5003 7632

银行行号: 1052 9003 7008

转账附言:  分子动力学上海+姓名+单位”

2.现场支付:支持人民币付款和支付宝转账。


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技术支持

鸿之微科技(上海)股份有限公司愿竭力为用户和企业提供全方位的技术支持和服务。

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  • MOMAP软件交流QQ群 397194316
  • RESCU软件交流QQ群 530537348
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