索引

A

average_along_axis()（在 dspawpy.plot 模块中）

B

build_Structures_from_datafile()（在 dspawpy.io.structure 模块中）

C

convert()（在 dspawpy.io.structure 模块中）

count_tree()（在 dspawpy.io.utils 模块中）

D

d_band()（在 dspawpy.io.utils 模块中） dspawpy module dspawpy.analysis module dspawpy.analysis.aimdtools module dspawpy.analysis.post_relax module dspawpy.analysis.vacf module dspawpy.cli module dspawpy.cli.auxiliary module dspawpy.cli.entrypoint module dspawpy.cli.menu10 module dspawpy.cli.menu13 module dspawpy.cli.menu15 module dspawpy.cli.menu3 module dspawpy.cli.menu4 module dspawpy.cli.menu5 module

dspawpy.cli.menu6 module dspawpy.cli.menu8 module dspawpy.cli.menu9 module dspawpy.cli.menu_prompts module dspawpy.diffusion module dspawpy.diffusion.neb module dspawpy.diffusion.nebtools module dspawpy.diffusion.pathfinder module dspawpy.io module dspawpy.io.export module dspawpy.io.read module dspawpy.io.structure module dspawpy.io.utils module dspawpy.io.write module dspawpy.plot module

E

elements2masses()（在 dspawpy.io.utils 模块中）

F

Formula（dspawpy.io.utils 中的类）

from_endpoints()（dspawpy.diffusion.pathfinder.IDPPSolver 类方法）

G

get_absfile()（在 dspawpy.io.utils 模块中） get_args()（在 dspawpy.cli.entrypoint 模块中） get_band_data()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_coordination_number() （dspawpy.analysis.aimdtools.RDF 方法） get_distance()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） get_dos_data()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_ele_from_h5()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_energies()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_energies_vdw()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_enthalpy() （dspawpy.io.utils.IdealGasThermo 方法） get_entropy() （dspawpy.io.utils.IdealGasThermo 方法） get_gibbs_energy() （dspawpy.io.utils.IdealGasThermo 方法） get_input()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） get_inputs()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） get_lagtime_msd()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） get_lagtime_rmsd()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） get_lims()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） get_lines_without_comment()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_ma()（在 dspawpy.io.utils 模块中） get_max_forces()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中）

get_max_forces_and_energies()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_max_forces_and_energies_vdw()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_max_forces_vdw()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_min_structure()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_min_structure_vdw()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_neb_subfolders()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） get_one_rdf() （dspawpy.analysis.aimdtools.RDF 方法） get_phonon_band_data()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_phonon_dos_data()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_raw_from_structure()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） get_rdf() （dspawpy.analysis.aimdtools.RDF 方法） get_relaxing_xyz()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_relaxing_xyz_vdw()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中） get_rs_rdfs()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） get_sinfo()（在 dspawpy.io.read 模块中） get_unit_vector()（dspawpy.diffusion.pathfinder.IDPPSolver 静态方法） get_ZPE_correction() （dspawpy.io.utils.IdealGasThermo 方法） getEwtData()（在 dspawpy.plot 模块中） getTSads()（在 dspawpy.io.utils 模块中） getTSgas()（在 dspawpy.io.utils 模块中） getZPE()（在 dspawpy.io.utils 模块中）

H

handle_duplicated_output()（在 dspawpy.io.write 模块中）

HidePrints（dspawpy.cli.menu9 中的类）

I

IdealGasThermo（dspawpy.io.utils 中的类） idpp_interpolate() （dspawpy.diffusion.neb.NEB 方法）

IDPPSolver（dspawpy.diffusion.pathfinder 中的类） iofunction（dspawpy.io.utils 中的类）

L

label_to_symbol()（在 dspawpy.io.utils 模块中）

linear_interpolate() （dspawpy.diffusion.neb.NEB 方法） load_h5()（在 dspawpy.io.read 模块中）

M

main()（在 dspawpy.cli.entrypoint 模块中） mirror()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） module dspawpy dspawpy.analysis dspawpy.analysis.aimdtools dspawpy.analysis.post_relax dspawpy.analysis.vacf dspawpy.cli dspawpy.cli.auxiliary dspawpy.cli.entrypoint dspawpy.cli.menu10 dspawpy.cli.menu13 dspawpy.cli.menu15 dspawpy.cli.menu3 dspawpy.cli.menu4 dspawpy.cli.menu5 dspawpy.cli.menu6 dspawpy.cli.menu8 dspawpy.cli.menu9 dspawpy.cli.menu_prompts dspawpy.diffusion dspawpy.diffusion.neb dspawpy.diffusion.nebtools dspawpy.diffusion.pathfinder dspawpy.io dspawpy.io.export dspawpy.io.read dspawpy.io.structure dspawpy.io.utils dspawpy.io.write dspawpy.plot

monitor_force_energy()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） MSD（dspawpy.analysis.aimdtools 中的类）

N

NEB（dspawpy.diffusion.neb 中的类）

norm_int()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中）

O

online_check()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中）

P

pad_zeros()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） parse()（在 dspawpy.io.utils 模块中） parse2()（在 dspawpy.io.utils 模块中） pdos()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） plot_aimd()（在 dspawpy.plot 模块中） plot_bandunfolding()（在 dspawpy.plot 模块中） plot_barrier()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） plot_dos()（在 dspawpy.plot 模块中） plot_msd()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） plot_neb_converge()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） plot_optical()（在 dspawpy.plot 模块中）

plot_phonon_thermal()（在 dspawpy.plot 模块中） plot_polarization_figure()（在 dspawpy.plot 模块中） plot_rdf()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） plot_rmsd()（在 dspawpy.analysis.aimdtools 模块中） pltbd()（在 dspawpy.plot 模块中） pre_ele_band()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） pre_ele_dos()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） pre_ele_pband()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） pre_ele_pdos()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） pre_ph_band()（在 dspawpy.cli.menu9 模块中） pre_ph_dos()（在 dspawpy.cli.menu9 模块中） printef()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中）

R

RDF（dspawpy.analysis.aimdtools 中的类） read()（在 dspawpy.io.structure 模块中） read_band()（在 dspawpy.io.export 模块中） read_dos()（在 dspawpy.io.export 模块中） read_relax_data()（在 dspawpy.analysis.post_relax 模块中）

reader()（在 dspawpy.io.utils 模块中） restart()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） RMSD（dspawpy.analysis.aimdtools 中的类） run() （dspawpy.analysis.aimdtools.MSD 方法） run() （dspawpy.analysis.aimdtools.RMSD 方法） run() （dspawpy.diffusion.pathfinder.IDPPSolver 方法）

S

s10_1()（在 dspawpy.cli.menu10 模块中） s10_2()（在 dspawpy.cli.menu10 模块中） s10_3()（在 dspawpy.cli.menu10 模块中） s10_4()（在 dspawpy.cli.menu10 模块中） s10_5()（在 dspawpy.cli.menu10 模块中） s11()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） s12()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） s13_1()（在 dspawpy.cli.menu13 模块中） s13_2()（在 dspawpy.cli.menu13 模块中） s14()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） s15_1()（在 dspawpy.cli.menu15 模块中） s15_2()（在 dspawpy.cli.menu15 模块中） s2()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） s3_1()（在 dspawpy.cli.menu3 模块中） s3_2()（在 dspawpy.cli.menu3 模块中） s3_3()（在 dspawpy.cli.menu3 模块中） s4_1()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s4_2()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s4_3()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s4_4()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s4_5()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s4_6()（在 dspawpy.cli.menu4 模块中） s5_1()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） s5_2()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中）

s5_3()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） s5_4()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） s5_5()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） s5_6()（在 dspawpy.cli.menu5 模块中） s6_1()（在 dspawpy.cli.menu6 模块中） s6_2()（在 dspawpy.cli.menu6 模块中） s7()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） s8_1()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_2()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_3()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_4()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_5()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_6()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s8_7()（在 dspawpy.cli.menu8 模块中） s9_1()（在 dspawpy.cli.menu9 模块中） s9_2()（在 dspawpy.cli.menu9 模块中） s9_3()（在 dspawpy.cli.menu9 模块中） save_figure_dpi300()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中） set_pbc()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） slicetake()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） string2symbols()（在 dspawpy.io.utils 模块中） strip_number()（在 dspawpy.io.utils 模块中） sum()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） summary()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中）

T

to_file()（在 dspawpy.io.write 模块中）

V

vacf()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中）

verify_dspawpy_version()（在 dspawpy.cli.auxiliary 模块中）

W

welch()（在 dspawpy.analysis.vacf 模块中） write()（在 dspawpy.io.structure 模块中） write_delta_rho_vesta()（在 dspawpy.io.write 模块中） write_json_chain()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中）

write_movie_json()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） write_neb_structures()（在 dspawpy.diffusion.neb 模块中） write_VESTA()（在 dspawpy.io.write 模块中） write_xyz()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中） write_xyz_chain()（在 dspawpy.diffusion.nebtools 模块中）